Depuis le début de la pandémie, les tests de diagnostic ont joué un rôle essentiel dans le contrôle de la propagation du SRAS-CoV-2, le virus qui causeCOVID 19.Tests antigéniques rapideseffectués à domicile ou en milieu clinique fournissent des résultats en 15 minutes ou moins.Plus tôt une personne est diagnostiquée, plus tôt elle pourra consulter un médecin et s’isoler des autres.Mais lorsque de nouvelles variantes du virus apparaissent, ces variantes peuvent ne pas être détectées par ces tests.
La plupart des tests antigéniques rapides sont conçus pour détecter la protéine nucléocapside du SRAS-CoV-2 ou la protéine N.Cette protéine se trouve en abondance dans les particules virales et chez les personnes infectées.Kit de test rapideLes anticorps contiennent généralement deux anticorps diagnostiques différents qui se lient à différentes parties de la protéine N.Lorsqu'un anticorps se lie à la protéine N dans un échantillon, une ligne colorée ou un autre signal apparaît sur le kit de test, indiquant une infection.
La protéine N est constituée de 419 unités structurelles d'acides aminés.N'importe lequel d'entre eux peut être remplacé par un autre acide aminé par mutation.Groupe de recherche dirigé par un doctorat.Philip Frank et Eric Ortlund de l'Université Emory ont entrepris d'étudier comment ce changement d'acide aminé unique affecte les performances d'un test antigénique rapide.Ils ont utilisé une technique appelée analyse de mutation profonde pour évaluer simultanément comment chaque mutation de la protéine N du virus affecte la liaison à un anticorps diagnostique.Leurs résultats ont été publiés dans Cell le 15 septembre 2022.
Les chercheurs ont créé une bibliothèque complète de près de 8 000 mutations de la protéine N.Ces variantes représentent plus de 99,5 % de toutes les mutations possibles.Ils ont ensuite évalué comment chaque variante interagissait avec 17 anticorps diagnostiques différents utilisés dans 11 tests antigéniques rapides disponibles dans le commerce, y compris des tests courants.kits maison.
L’équipe a évalué quelles mutations de la protéine N affectent la reconnaissance des anticorps.Sur la base de ces informations, ils ont créé un « profil de mutation d’échappement » pour chaque anticorps diagnostique.Ce profil identifie des mutations spécifiques dans la protéine N qui peuvent affecter la capacité de l'anticorps à se lier à sa cible.L'analyse a montré que les anticorps utilisés dans les tests rapides d'aujourd'hui reconnaissent et se lient à toutes les variantes préoccupantes et préoccupantes passées et présentes du SRAS-CoV-2.
Bien que plusieurs anticorps diagnostiques reconnaissent la même région de la protéine N, les chercheurs ont découvert que chaque anticorps possède une signature unique de mutations d’évasion.Alors que le virus SARS-CoV-2 continue de muter et de générer de nouveaux variants, ces données peuvent être utilisées pour signaler les anticorps du kit de test qui pourraient devoir être réévalués.
« L’identification précise et efficace des personnes infectées reste une stratégie essentielle pour atténuer le COVID-19, et notre étude fournit des informations sur les futures mutations du SRAS-CoV-2 qui pourraient interférer avec la détection », a déclaré Ortlund.« Les résultats présentés ici nous permettent de nous adapter rapidement à ce virus alors que de nouveaux variants continuent d’apparaître, présentant des implications cliniques et de santé publique immédiates. »
Contexte : Mutation Deep Scan détecte les mutations d’échappement dans la nucléocapside du SRAS-CoV-2 à l’aide des tests antigéniques rapides actuellement disponibles.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA cell.15 septembre 2022;185(19):3603-3616.e13.Ministère de l'Intérieur : 10.1016/j.cell.2022.08.010.29 août 2022 PMID : 36084631.
Financement : Institut national d'imagerie biomédicale et de bioingénierie NIH (NIBIB), Institut national du diabète, des maladies digestives et rénales (NIDDK) et Institut national des allergies et des maladies infectieuses (NIAID), American Heart Association.
NIH Research Matters est une mise à jour hebdomadaire des principaux résultats de recherche du NIH examinés par des experts du NIH.Il est publié par le Bureau des communications et des affaires publiques du directeur des National Institutes of Health.